蘑菇渣不发酵直接使用的坏处：
（1）未经发酵的菇渣施加到土壤中后，在发酵过程中会产生较多的热量，影响到作物的根系部分生长。
（2）未经发酵的菇渣中施加到土壤中后，容易引起病虫害。
（3）未经发酵的菇渣大多为有机态或者是缓效态，家禽饲料蘑菇渣，不能直接被作物吸收利用。
（4）菇渣在发酵过程中，会消耗较多的氧气，导致作物处于缺氧状态，蘑菇渣价格，进而影响作物的生长。
食用菌生产者在蘑菇采收后，感到麻烦的是留下来的废料，既占在地方又污染环境。利用蘑菇渣和粗纤维降解菌通过发酵配制生物有机肥，既减少环境污染为食用菌生产者解决了麻烦，又可增加对生物资源的多层次利用，提高生态效益，实现废物循环利用和农业可持续发展。
蘑菇渣为主原料生产生物有机肥的方法，操作工艺简便快捷、所需条件简单，生产成本低，适合大规模普及推广应用。
蘑菇渣做有机肥的方法步骤：
1.用量比例：1公斤微生物菌液可以发酵200公斤的蘑菇渣，废弃的蘑菇棒要先粉碎下在进行发酵。一般发酵时，禁止用500公斤或一立方以下的物料做实验。菌液兑水稀释和物料发酵混合均匀堆放发酵即可。因这几种物料的碳氮比都比较高，为达到较好的软化效果，可以适当加一些尿素。
2.拌匀通气：发酵物料时一定要搅拌均匀，注意翻动，蘑菇渣有机肥，通气为宜。
3.水分控制：发酵物料的水分应控制在50%左右，水分判断：手抓一把物料，见水印但不滴水，落地即散为宜。水少发酵慢，水多通气差，潍坊蘑菇渣，可根据物料实际情况具体掌握。
4.温度控制：启动发酵温度在15℃以上为好，发酵一周左右即可。冬天气温低可以发酵时间长点。
5.发酵完成：物料达到软化效果即可停止发酵，发酵时间过长，会消耗物料里面过多的纤维素等。
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